在教育教学方面，南京铁道职业技术学院设有运输管理学院、通信信号学院、机车车辆学院、供电与工程学院、财经与物流管理学院、建筑与艺术设计学院、智能工程学院等二级学院，共开办36个专科专业。这些专业涵盖了轨道交通行业的各个领域，构建了以轨道交通专业为优势和特色的专业群体系。其中，铁道交通运营管理专业群被列为国家“双高”建设专业群，轨道交通类专业在行业内处于领先地位，会计、艺术设计等地方专业也在省内享有盛誉。
学校师资力量雄厚，拥有一支高素质、专业化的教师队伍。现有教职工604人，其中专任教师325人，具有高级职称的教师111人，硕士学位教师198人，博士学位教师12人。此外，还有江苏省“青蓝工程”优秀青年骨干教师培养对象、江苏省高等学校优秀教学团队等荣誉获得者。他们在教学和科研方面取得了显著成就，为学生提供了优质的教育资源和良好的学术氛围。
在科研与社会服务方面，南京铁道职业技术学院也取得了丰硕成果。近年来，学校积极服务交通强国战略，紧盯轨道交通和区域发展，不断提升科技创新能力，推进科技成果转化。学校与多家企业合作，共同开展科研项目和技术攻关，取得了一系列重要成果。其中，《城市轨道交通信号数据自动配置系统的开发与应用》项目获得了江苏省高等学校科学技术研究成果奖三等奖，该项目实现了城轨信号系统数据的自动配置、安全验证和工程优化，有效提高了城轨信号系统的RAMS指标，为轨道交通行业的发展做出了重要贡献。
