学院的前身可以追溯到1951年由西南军政委员会卫生部创办的重庆中医进修学校，历经多次更名与变革，最终在2023年由重庆医科大学中医药学院、重庆市中医院、重庆市中药研究院、重庆市药物种植研究所整合组建而成。这一历程不仅积淀了深厚的学术底蕴，也赋予了学院独特的办学特色和优势。
重庆中医药学院占地面积广阔，规划总占地面积达到1686.47亩，为师生提供了宽敞的学习和生活环境。学院内教学设施完善，拥有价值约1.4亿元的教学科研仪器设备，以及丰富的纸质藏书51万册，这些资源为师生的教学和研究提供了坚实的支撑。
在学科设置上，学院注重中医中药并重，开设了中医学、中药学、针灸推拿学、中医骨伤科学、中西医临床医学、中药制药等多个本科专业。这些专业不仅涵盖了中医药领域的核心学科，还注重学科的交叉与融合，旨在培养具备扎实理论基础和实践能力的复合型人才。同时，学院还设有9个二级学院，包括中医学院、中药学院、针灸推拿学院、骨伤学院、中西医结合学院等，进一步细化了学科领域，提升了教学质量。
