制药工程学院招收药物化学、制药工程专业博士研究生。招收药物化学、制药工程、生物化工、应用化学、化学工艺、化学工程、环境化工、无机化学、有机化学、高分子化学与物理、环境化学等11个专业的学术型硕士研究生以及药学（药物化学方向）专业学位硕士、制药工程（工程领域）硕士研究生。开设制药工程、环境科学、应用化学、药物化学4个专业本科生，制药工程专业被教育部评为国家特色专业。药学学科在全国第四轮学科评估中获得 “A”。“十二五”以来，承担国家科技重大专项课题、国家自然科学基金项目等国家级项目50项，省、市级科研项目118余项，转让科技成果200余项。与军事医学科学院、北京大学、吉林大学等单位建立合作办学、合作研究和合作培养研究生。