2018年，南科大入选博士学位授权单位及硕士学位授权单位。截至目前，南科大获批数学、物理学、生物学、力学、化学、地球物理学、集成电路科学与工程、电子科学与技术、材料科学与工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、环境科学与工程、生物医学工程、临床医学、管理科学与工程共15个硕士学位授权一级学科，以及材料与化工、金融、电子信息、机械、资源与环境、生物与医药、临床医学、工商管理共8个硕士专业学位授权点，获批数学、物理学、生物学、力学、化学、地球物理学、材料科学与工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、环境科学与工程、生物医学工程、集成电路科学与工程、临床医学、管理科学与工程共14个博士学位授权点，以及材料与化工、电子信息、机械共3个博士专业学位授权点。南科大已形成完整系统的学科体系。
