卫生检验与检疫专业就业理论范畴广泛，可就职于各级卫生行政主管部门参与政策制定，在疾病预防控制中心开展传染病监测防控等工作，还能在地方病、职业病防治所、环保局、食品药品监督局、海关等多部门发挥专业作用。

但现实中，该专业毕业生就业受医学检验技术专业“压制”，很多岗位更青睐后者。考公和事业编竞争大，岗位少且限制多，不少学生无奈前往经济欠发达城市或基层县级疾控中心，面临薪资低、发展受限的问题。相对友好的是第三方检验机构，如外企SGS不限制专业、待遇优但对英语要求高，国企金域检验就业机会有但待遇一般。整体来说，专业就业率尚可，但相比其他相关专业不占优势，学生需努力提升竞争力。

开设该专业的院校少，主要是医药类和综合类。医药类院校依托医学资源培养更专业，综合类院校营造跨学科氛围。四川大学医学实力强劲，该专业师资和设施一流；南京医科大学专业底蕴深厚，重视实践教学，与众多机构合作紧密，为学生提供丰富实践机会。