管理科学与工程：在教育部组织的学科评估中获评 A 类，是该校的王牌学科之一，也是国家重点一级学科、世界一流学科建设点。该学科是一个集工程学、经济学和管理学为一体的多学科交叉的综合性学科群，在国内具有较高的影响力和竞争力。
机械工程：学科评估结果为 B+。合肥工业大学的机械设计制造及其自动化专业是国家级特色专业，为该校创办最早的专业之一，人才培养依托于机械设计及理论国家级重点学科、机械工程安徽省 A 类重点学科。该专业拥有多个国家级实验教学示范中心和虚拟仿真实验教学示范中心，还拥有博士后流动站、博士点和硕士点，并且通过了国际工程教育专业认证。
仪器科学与技术：学科评估为 B+。学校在该学科领域有较强的教学和科研实力，测控技术与仪器专业是国家级特色专业，培养的学生在精密仪器、测量与控制等领域具有较高的专业素养和实践能力。
计算机科学与技术：学科评估结果为 B+。该专业是国家级一流本科建设专业，在人工智能、大数据、计算机系统结构等方向具有较强的研究实力和教学水平，培养的学生具备扎实的计算机理论基础和实践能力，能够在计算机相关领域从事研发、设计、管理等工作。
电气工程：学科评估为 B 类。电气工程及其自动化专业是国家级特色专业，通过了全国工程教育专业认证，获批国家级一流本科专业建设点。该专业在可再生能源分布式发电技术、新能源发电变流技术、特种电机设计及控制、高电压与绝缘等方向具有鲜明特色，毕业生就业前景广阔。
材料科学与工程：学科评估为 B 类。学校在材料科学领域拥有优秀的师资队伍和先进的实验设备，在金属材料、无机非金属材料、新能源材料等方向开展了深入的研究和教学工作，为国家培养了大量的材料科学与工程专业人才。
食品科学与工程：学科评估为 B 类。该专业是国家级特色专业，拥有国家级教学团队和精品课程，在食品加工、食品质量与安全、食品营养等方面具有较强的教学和科研实力，为食品行业的发展做出了重要贡献。
车辆工程：国家级特色专业、国家级首批一流本科专业，创办于 1958 年，是我国大学中最早设置的汽车专业之一，2018 年通过教育部第二轮工程教育认证专业。该专业培养的学生掌握车辆工程领域的专业知识和技能，能够在汽车整车及零部件、电子控制、交通运输等领域的企事业单位从事相关的研发、设计、制造、管理等工作。
土木工程：学科评估结果为 B 类，是国家级特色专业。该专业培养的学生具备扎实的土木工程理论基础和实践能力，能够在建筑工程、道路桥梁工程、地下工程等领域从事设计、施工、管理等工作。