中大专门制定强基计划本科、硕士、博士有效衔接的培养方案，实行本硕博衔接培养。本科阶段夯实基础学科能力素养，硕博阶段既可在本学科深造，也可进行学科交叉培养。
在课程上，开设面向学科前沿和国家战略需求的前沿课程和具有高阶性、创新性和挑战度的专业课程；打通课程修读的知识体系，强基计划学生在修读完本科规定课程的基础上，可在导师指导下提前修读研究生课程。
中大强基计划实行年度考核及动态进出机制。每学年结束后根据学生课程成绩、科研训练表现等方面综合考核进行动态管理，本科阶段分流与考核淘汰的学生转入普通本科专业培养。有志向、有兴趣、有天赋且学业成绩优秀的普通录取本科生可选拔补入强基计划。
中大强基计划学生单独编班，完成规定的本科阶段有关课程，达到转段要求且通过相关考核者，进入本校研究生培养阶段；同时，在公派留学，奖学金评审等方面，中大按教育部规定支持强基计划学生。